構成管理ツールを使用する場合、ソフトウェアによって構成管理に関する問題のほとんどが処理されます。ただし、ファイル管理システムでは、コピーまたは参照による共有と構成管理ツールの使用を組み合わせて取り込むことができます。
互いに遠く離れた場所にいるチーム・メンバーを含むソフトウェア開発チームには、さらに課題に直面します。このような場合、遠く離れた場所にいるチーム・メンバー間のコラボレーションを可能にするテクノロジー (Web など) を、全体的なファイル管理戦略に取り入れることができます。詳細については、複数サイトにわたるコラボレーションを参照してください。
複雑なファイル・システムを使用し、さまざまなチームが携わるプロジェクトでは、多くの場合、チーム・コラボレーションの複数のメソッドが取り入れられた、構成管理に対する独創的なソリューションが必要です。例えば、チーム・メンバーは従来の構成管理ツールのファイルにチェックインおよびチェックアウトできます。同時にプロジェクトでは、他のプロジェクトから、または他の外部仕様ファイルからクラスを参照することができます。