È possibile eseguire il debug dei pluglet proprio come per qualsiasi altro file di origine Java. Poiché i pluglet vengono eseguiti nel workbench corrente, è necessario eseguirne il debug da un workbench differente. Un meccanismo automatico per avviare un altro workbench per il debug dei pluglet è fornito dalla funzione Pluglet.
Il workbench del debugger viene avviato mediante una configurazione speciale che include solo i plug-in delle funzioni necessarie per il debug del pluglet, come ad esempio le funzioni Pluglet, Java, Debug, Team, PDE, Piattaforma e Guida. Questa configurazione viene avviata più rapidamente e utilizza meno memoria del workbench di destinazione.