Rational Functional Tester supporta l'esecuzione di test di tutte le versioni di SAP R/3 mediante la SAPGUI in esecuzione su Windows. Le versioni supportate di SAPGUI sono 6.20, 6.40, 7.1 e 7.2 con livello di patch 52 o successivo.
Mediante questo supporto, è possibile utilizzare Rational Functional Tester per registrare e riprodurre gli script sull'UI SAP con riconoscimento affidabile in relazione ai controlli SAP, inclusa la verifica di dati personalizzati dei controlli SAP. Il supporto Rational Functional Tester è sviluppato e realizzato sul framework di script della GUI SAP, proponendo tutte le funzionalità di script fornite da SAP, oltre all'aggiungere un valore significativo attraverso le funzionalità ereditate da Rational Functional Tester.