Rational Directory Server supporta SSO con altre applicazioni Rational. Gli utenti di Rational Directory Server si collegano mediante un token, che può essere presente in un cookie o nell'URL come parametro. Se Rational Directory Server convalida il token, l'utente verrà collegato automaticamente a Rational Focal Point. Se non è presente alcun token, l'utente sarà reindirizzato alla pagina Login. Questa funzione è disponibile quando Rational Directory Server è abilitato e non può essere disabilitato separatamente.
Per ogni utente, compresi gli amministratori, è possibile avere soltanto un metodo di autenticazione selezionato, ma è possibile attivare sia Rational Directory Server che SSO Web per un'installazione. È possibile attivare entrambi i metodi in modo che gli utenti regolari possano eseguire l'autenticazione utilizzando SSO Web mentre gli amministratori eseguono l'autenticazione tramite Rational Directory Server. In questo caso, gli amministratori potranno utilizzare Rational Directory Server per aggiungere e gestire gli utenti e gli utenti regolari potranno essere collegati al prodotto automaticamente.
Per aggiungere gli utenti in Rational Directory Server, gli amministratori devono avere l'attributo du autenticazione impostato su Rational Directory Server. Gli amministratori con l'attributo di autenticazione impostato su SSO (Single Sign-On) Web o su Standard potranno aggiungere gli utenti soltanto a Rational Focal Point.